Osnovno načelo Strategije, koju je predložila Vlada, jest autonomija svih institucija u području obrazovanja i znanosti, kao i autonomija svih djelatnika. Autonomija pretpostavlja preuzimanje odgovornosti za uspješan ishod obrazovnog procesa, što se provjerava sustavom samovrednovanja i vanjskog vrednovanja.
Ustanovama i zaposlenicima, uspješnost mora donositi dodatne poticaje, a neuspješnost pomoć, odnosno sankcije. Misija hrvatskoga obrazovnog sustava je osigurati kvalitetno obrazovanje dostupno svima pod jednakim uvjetima, u skladu sa sposobnostima svakoga korisnika.
Proces provedbe Strategije, što uključuje odgovarajuće zakonodavstvo te konkretne mjere i odluke, mora pratiti potpora svih ministarstava, agencija i ostalih državnih institucija te koordinacija svih strategija koje se dotiču obrazovanja i znanosti.
Provedbu Strategije koordinirat će i pratiti Posebno stručno povjerenstvo pri Uredu predsjednika Vlade Republike Hrvatske.
